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Enzymes qui stabilisent les boucles d'ADN

Enzymes qui stabilisent les boucles d'ADN



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Pour faire suite à une question précédente, j'aimerais savoir quelles enzymes ou complexes protéiques ont été utilisés pour manipuler des échantillons d'ADN en boucles d'ADN stabilisantes.

J'ai lu que la cohésine est l'une de ces enzymes, mais fonctionne comme un facteur de transcription en se liant à des motifs d'ADN spécifiques.

Mon intérêt est de savoir quelles autres enzymes créeront des boucles d'ADN sans biais de motif d'ADN à partir d'une extraction d'ADN.

Il s'agit d'une question complémentaire à celle-ci, car en fin de compte, j'aimerais savoir s'il pourrait y avoir des moyens d'optimiser le processus de circularisation de l'ADN de très longues étendues d'ADN double brin humain (ou mammifère), de plusieurs kilobases à mégabases, en créant d'abord des boucles d'ADN stables qui laissent deux extrémités d'ADN à proximité pour un processus de ligature plus efficace.

Des idées?


J'ai lu que la cohésine est l'une de ces enzymes, mais fonctionne comme un facteur de transcription en se liant à des motifs d'ADN spécifiques.

La liaison de la cohésine ne dépend pas du motif (comme les facteurs de transcription) et est également dynamique. Bien que la séquence puisse avoir un rôle, c'est, comme dans le cas des nucléosomes, principalement la composition globale plutôt qu'un motif basé sur la séquence :

De cet article :

Les pics de liaison de la cohésine correspondent étroitement aux pics de composition AT locale élevée, une périodicité de composition de base de 15 kb qui est distincte de la périodicité de ∼50 kb des isochores de composition de base, compatible avec l'association des axes des cohésines.

Les complexes ADN-protéine peuvent être réticulés et par la suite les boucles peuvent être tirées vers le bas. Cependant, cela est délicat. Vous auriez besoin de couper l'ADN aux extrémités de la boucle afin de les ligaturer ensemble. Je ne sais pas comment faire (peut-être en utilisant un anticorps lié à une endonucléase).


Voir la vidéo: Les enzymes de restriction Biochimie. Biologie Moléculaire (Août 2022).